高分辨率,超灵敏和本地蛋白质组学

亮亮的阳光

助理教授

229 CEM

517-353-0498


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主要研究领域

分析(一)

其他感兴趣的面积(S)

生物(BI)

材料(毫安)

研究

(研究说明 PDF格式)

蛋白质组学识别身份和AIMS全面蛋白质进行量化在生物系统中,治疗包括蛋白质表达,定位,相互作用,翻译后修饰(翻译后修饰)和翻身。常规它采用用于蛋白质鉴定反相液相色谱法(RPLC)-electrospray电离(ESI)质谱-Tandem(MS / MS)。毛细管区带电泳-ESI-MS / MS吸引也有蛋白质组学由于其优势特征的高度关注。第一,czems和RPLC-MS可以产生互补标识和的这两种技术可以提高增加规模蛋白质组的组合,尤其是增强proteoform标识。第二,CZE可以产生比完整蛋白质RPLC受益自上而下蛋白质组学更好的分离。第三,CZE-MS可以产生比RPLC-MS检测的肽和完整蛋白的更高的灵敏度。四,捷克能在天然条件下分离蛋白质。 CZE-MS / MS将用于蛋白质组学,旨在天然接近内源性蛋白复合物的表征proteomescale在细胞中的宝贵工具。

我们的研究主要集中在基于CZE-MS / MS高分辨率,超灵敏和本地蛋白质组学和生物重要回答问题的新方法的应用新的分析方法的开发。

多维LC-CZE-MS /用于高分辨率和超灵敏蛋白质组学MS。
多维LC-CZE-MS /用于高分辨率和超灵敏蛋白质组学MS。

(一世) 多维耦合捷克LC-MS /高分辨率和超灵敏的蛋白质组学毫秒。我们采用正交分离技术,以提高肽和蛋白质组复杂的完整蛋白质的分离,从蛋白质组学促进蛋白质组覆盖。我们整合微尺度RPLC(μrplc)同CZE-MS / MS提高蛋白质组学的灵敏度,可实现大容量有限的样品深蛋白质组学。我们与发育生物学家合作,运用我们的技术理解的重要问题,在脊椎动物胚胎发育早期的斑马鱼作为模型系统。特别是我们感兴趣的是两个重要的问题。首先,怎么办蛋白和/或翻译后修饰他们的精确控制合子基因激活在中囊胚过渡?第二,何时及如何interblastomere出现分歧在早期细胞分化?我们相信,斑马鱼的胚胎,并在多个发育阶段的卵裂球的定量蛋白质组学将提供宝贵的洞察这些问题。

仲CZE-MS / MS对天然蛋白质组学。
仲CZE-MS / MS对天然蛋白质组学。

(ⅱ) 制定本地的蛋白质组学分析方法。我们夫妇尺寸排阻色谱法(SEC)至CZE-MS /用于在天然条件下的复杂蛋白质组的高分辨率分离MS。将仲丁基CZE-MS / MS将使大规模鉴定和从复杂样品直接蛋白质组和在发现模式的蛋白质复合物的相对定量。特别是我们感兴趣的蛋白质 - 金属配合物的表征细胞。

固定化的胰蛋白酶CZE-MS /蛋白质组学MS高吞吐量。
固定化的胰蛋白酶CZE-MS /蛋白质组学MS高吞吐量。

(ⅲ) 基于夫妇磁性微球固定化胰蛋白酶快速CZE-MS / MS高通量蛋白质组。的状态的最先进的蛋白质组学平台需要12小时,至少对于样品制备,RPLC-MS / MS,和数据分析。相对较低的吞吐量阻碍蛋白质组学日常和全系统的临床诊断中的应用。我们的目标是提高超过一个数量级的提高蛋白质组学的吞吐量,接近halfan-小时蛋白质组学。我们相信该技术每天将促进和全系统的临床诊断

选择的出版物

单次自上而下的蛋白质组学毛细管区electrophoresis-电喷雾电离 - 串联质谱法对大肠杆菌的识别大肠杆菌近600 proteoforms,Lubeckyj,RA;麦库尔,在;沉,X;寇,Q;柳,X;太阳湖, 肛门。化学。 2017, 89,12059-12067。

本地使用模式蛋白质组学发现在尺寸排阻色谱 - 毛细管区带电泳 - 串联质谱法,沉,X,寇,Q,郭河,杨,Z,陈,d,刘X,香港,H,太阳湖, 分析化学。 2018,我,10095-10099。

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毛细管区带电泳 - 串联质谱法用于大规模生产的磷酸化蛋白质组学的利用来自细胞系11000磷酸结肠癌HCT116, 陈,d。,路德维希,K。,Krokhin,O.V.,斯派塞,V。,阳,Z。,沉,X。,Hummon,A.B.,太阳,升。, 分析化学。 2019, 91(3),2201年至2208年。

简历

学士学位,2005年,大连理工大学;

博士,2011年,中国科学院大连化学物理研究所,中国中院院士科学

博士后研究员(2011-12)和研究助理教授(2013-16),大学。巴黎圣母院

奖项/荣誉